В центре сюжета история двух братьев-алхимиков Эдварда и Альфонса Элриков, которые оказываются в опасности после того, как некий таинственный убийца начинает преследовать всех алхимиков и карать их за грехи от имени Бога.
«Стальной алхимик: Финальная трансмутация» — приключенческое фэнтези по мотивам манги «Стальной алхимик».