Во время Великой Отечественной войны немецкие войска, занявшие Киев 19 сентября 1941 года, использовали Бабий Яр как место массовых расстрелов. Первый расстрел произошёл 27 сентября 1941 года — были расстреляны 752 пациента психиатрической больницы им. Ивана Павлова, которая находилась в непосредственной близости к оврагу. Точное место расстрела неизвестно[8]. 24 сентября на Крещатике были подорваны дома, в которых располагались представители оккупационной администрации. Взрывы и пожары продолжились в последующие дни, было уничтожено около 940 крупных жилых и административных зданий. В отчёте представителя имперского министерства оккупированных восточных областей от 5 октября 1941 года говорилось, что пожар распространился на площади 200 тысяч м², без крова осталось около 50 тысяч человек[9]. В конце сентября 1941 года зондеркоманда захватила девять ведущих раввинов Киева и приказала им сделать воззвание: «После санобработки все евреи и их дети, как элитная нация, будут переправлены в безопасные места…»[11][12] 27—28 сентября нацистские власти отдали приказ о том, чтобы 29 сентября еврейское население города к 8 часам утра явилось в назначенную точку сбора с документами и ценными вещами. За невыполнение приказа полагался расстрел. По городу было расклеено около 2 тысяч объявлений. Одновременно через дворников и управдомов распространялась дезинформация о намерении провести перепись и переселение евреев. Большинство из пришедших составляли женщины, дети и старики (взрослое мужское население было призвано в армию), кроме евреев были представители других национальностей из интернациональных семей.  Менора. Бабий Яр, Киев В конце улицы был устроен пропускной пункт, за которым находилась скрытая со стороны канцелярия. Поочерёдно за пропускной пункт отводили 30—40 человек, где у них отбирали вещи и заставляли раздеваться. Затем полицаи с помощью палок загоняли людей в проходы в насыпи на краю оврага глубиной 20—25 метров. На противоположном краю находился пулемётчик. После того, как ров заполнялся 2—3 слоями трупов, сверху их присыпали землёй. Поскольку расстрелять всех прибывших за одни сутки не удалось, в качестве пункта временного содержания прибывших на ночь использовались помещения военных гаражей. Сохранившиеся цветные фотографии Й. Хеле, выполненные вскоре после расстрелов, не позволяли точно идентифицировать место, поскольку рельеф яра сильно изменился в послевоенный период, в особенности после Куренёвского оползня 1960-х гг. Тем не менее исследование, проведённое в 2020—2021 г., позволило сопоставить фотографии с аэрофотографиями того же времени и точно локализовать все места событий[14]. За два дня 29 и 30 сентября 1941 года зондеркоманда «4а» под командованием штандартенфюрера Пауля Блобеля (входившая в состав Айнзатцгруппы «С» под командованием бригаденфюрера СС и генерал-майора полиции Отто Раша) при участии 45-го и 303-го батальонов немецкой полиции порядка полицейского полка «Юг» и украинской вспомогательной полиции[15] расстреляли в этом овраге 33 771 человека (это количество не включает малолетних детей до 3 лет, которых тоже убивали в эти два дня). Зондеркоманда «4а» и 45-й батальон немецкой полиции порядка приняли непосредственное участие в расстрелах. Военнослужащие 303-го батальона немецкой полиции порядка стояли в оцеплении мест расстрела[16][17][18]. На этом расстрелы не прекратились. Дальнейшие расстрелы евреев прошли 1 и 2 октября, 8 октября и 11 октября 1941 года. Массовые казни продолжались вплоть до ухода немцев из Киева. 10 января 1942 года были расстреляны около 100 матросов Днепровского отряда Пинской военной флотилии. Бабий Яр стал местом расстрела пяти цыганских таборов. По разным подсчётам, в Бабьем Яру в период с 1941 по 1943 год было расстреляно от 70 000 до 200 000 человек. Евреи-заключённые, которых нацисты заставили сжигать тела в 1943 году, говорили о 70—120 тысячах. В феврале — марте 1942 года там же были расстреляны 621 член Организации украинских националистов (сторонников Андрея Мельника)[21][22][23] и поэтесса Елена Телига с коллегами из газеты «Украинское слово». Историк и педагог Илья Левитас[24] считает, что их убивали в застенках гестапо на Владимирской улице[25]. Кроме того, на месте военного лагеря частей Красной армии (бывший военный лагерь Русской императорской армии) был открыт Сырецкий концентрационный лагерь, в котором содержались коммунисты, комсомольцы, подпольщики, военнопленные и другие. 18 февраля 1943 года в нём были расстреляны трое игроков футбольной команды «Динамо» — участников так называемого «Матча смерти»: Трусевич, Кузьменко и Клименко (впоследствии было подтверждено, что их гибель не была связана с игрой, а легенду о связи смерти с проигрышем в «Матче смерти» сочинили, чтобы отвлечь внимание от еврейского аспекта трагедии Бабьего Яра[26][неавторитетный источник?]). Всего в Сырецком концлагере погибло по меньшей мере 25 000 человек. В Бабьем Яру создавался экспериментальный мыловаренный завод для выработки мыла из убитых, но достроить его немцы не успели[27]. Отступая из Киева и пытаясь скрыть следы преступлений, нацисты в августе — сентябре 1943 года частично уничтожили лагерь, откопали и сожгли на открытых «печах» десятки тысяч трупов, кости перемалывались на привезённых из Германии машинах, пепел был рассыпан по окрестностям Бабьего Яра. В ночь на 29 сентября 1943 года в Бабьем Яру произошло восстание занятых на работах у печей 329 заключённых-смертников, из которых спаслись 18 человек, остальные 311 были расстреляны. Спасшиеся узники выступили свидетелями попытки нацистов скрыть факт массового расстрела. В официальном сообщении Чрезвычайной государственной комиссии (ЧГК) о трагедии в Бабьем Яру, отредактированном в Управлении пропаганды ЦК ВКП(б) и утверждённом заместителем председателя Совета Народных Комиссаров СССР В. М. Молотовым, слово «евреи» было заменено на «мирные советские граждане»[28]. Исполнители расстрелов Трибуналом по айнзацгруппам (англ. The Einsatzgruppen Case) установлено, что расстрелы 29 и 30 сентября 1941 года в Бабьем Яру выполняла зондеркоманда «4а» айнзатцгрупы «С» под руководством штандартенфюрера СС Пауля Блобеля при поддержке 45-го и 303-го батальонов немецкой полиции (нем. Polizei-Bataillon) порядка полка полиции «Юг»[16][17][18]. Эти подразделения были усилены подразделениями вспомогательной полиции Украины и поддержаны местными коллаборационистами[1]. В публицистических статьях разных авторов можно найти документально не подтвержденную информацию об участии украинских националистов в расстрелах, в частности Буковинского куреня (которого в то время в Киеве не было)[29]. По показаниям Пауля Блобеля во время трибунала и за подтверждением 106 отчета айнзатцгрупп, украинская милиция (полиция) вывешивала объявление в Киеве[30]. Кроме того, немцы на оккупированных территориях вооружали украинскую вспомогательную полицию очень ограниченным количеством винтовок и патронов к ним, не включая в вооружение пулемёты, из которых проводились расстрелы в Бабьем Яру[31]. Процессы над виновными Генерал-майор Курт Эберхард, отдавший приказ о расстреле, не был осуждён — он покончил с собой в 1947 году в Штутгарте[32]. Начальник зондеркоманды «4a» Пауль Блобель был приговорён в 1948 году к смертной казни через повешение и казнён в 1951 году в Ландсбергской тюрьме[33]. Комендант Киевской полиции Андрей Орлик (настоящее имя Анатолий Конкель) был уволен из полиции вскоре после сентябрьских казней. В конце войны под именем Анатолий Орлик он служил в дивизии СС «Галичина» в звании сотника, попал в плен к западным союзникам и находился в лагере в Римини (Италия). Впоследствии, как и многие другие дивизионники из лагеря в Римини, Анатолий Конкель выехал в Великобританию, где жил под именем Анатолий Орлик и умер в Бирмингеме в мае 1989 года, на девяностом году жизни[34]. Генеральный комиссар Киева Хельмут Квитцрау к ответственности не привлекался, умер в 1999 году. Отто Раш, начальник айнзацгруппы «C», под чьим руководством были проведены массовые убийства евреев в Бабьем Яру, после войны был арестован и привлечён в качестве обвиняемого к процессу по делу об айнзацгруппах. Дело в отношении Раша было прекращено в связи с болезнью Паркинсона[35]. С 1967 по 1968 год в земельном суде Дармштадта проходил процесс над бывшими сотрудниками зондеркоманды «4a». Главный обвиняемый Куно Каллсен был приговорён к 15 годам заключения, Курт Ханс и Адольф Янссен — к 11 годам, Август Хефнер — к 9 годам, Виктор Войтон — к 7 годам, Кристиан Шульте — к 4 годам и 6 месяцам заключения, Александер Ризле — к 4 годам заключения[36]. Георг Пфарркирхер, Эрнст Конзее и Виктор Трилл были освобождены согласно § 47 уголовного кодекса ФРГ. Бывший штурмбаннфюрер СС и командир 45-го полицейского батальона Мартин Бессер не был привлечён к судебной ответственности по состоянию здоровья. После войны После освобождения Киева Красной армией 6 ноября 1943 года Сырецкий концентрационный лагерь использовался в качестве лагеря для немецких военнопленных до 1946 года. После этого лагерь был снесён, а на его месте в конце 1950-х — начале 1960-х был построен жилмассив Сырец и разбит парк им. Сорокалетия Октября (теперь Сырецкий парк).